确保洁净室内洁净度其间主要一个要素就是压差操控，利用压差阻隔操控洁净室不受污染阻隔相邻或外界的环境是有必要的。正压洁净室经过其内部压差高于外界环境确保外界污染不能侵入所受控环境以内，而生物安全试验室（存在有生物风险的试验室）则经过负压操控室内污染不会侵入外界环境当中。常用压差操控方法，基本有静态操控及动态操控两大类，其选用的概念各是：

静态控制

      适用于排风不变或至少一段时期内不变的状况下。能够说绝大局部干净室是静态控制压差的，而当门开启时，压差不能维持，呈现空气的互相交流与温差有关，常用对策是设缓冲室（气闸室），另外一种状况是允许暂时的空气的互相交流，不会影响产质量量等则可不设缓冲室（例如请求干净度较低的环境）。

动态操控

       适用于排风量改变的状况下。通常是由传感器根据室内设定压力主动调理新风量，以达到所请求之压差值。通常，宜以室内压差的保持来操控新风量（压差传感器），也有较特别的环境运用开口风速气流传感器进行压力调理；这种动态操控典型的是高风险度的生物安全试验室，当该试验室内敞开生物安全柜等排风设备时，就需要通风新风量主动操控室内压力状况。